Var hittas DNas I-överkänslighetsplatser och vad indikerar de om kromatinets natur? Dessa platser finns vid exon-intron-övergången och indikerar platsen för mRNA-klyvning under splitsning. Dessa platser finns slumpmässigt i genomet och det gör DNA sårbart för nedbrytning.
Vad är en DNase I-överkänslig plats och hur påverkar den kromatin?
I genetik är DNas I-överkänsliga platser (DHS) regioner av kromatin som är känsliga för klyvning av DNas I-enzymet. I dessa specifika områden av genomet har kromatin förlorat sin kondenserade struktur, exponerar DNA och gör det tillgängligt.
Vad föreslår en DNase-överkänslig webbplats?
Aktiva cis-regulatoriska element är överkänsliga för klyvning av endonukleaset DNas I. Motiv inom DNas I-överkänsliga platser indikerar potentiell transagerande faktorbeläggning och, i kombination med DNas I klyvningsdata, kan användas för att konstruera provisoriska regulatoriska nätverk.
Vad är DNase-överkänslighetsanalys?
I mer än två decennier har DNase I-överkänslighetsanalysen (DHA) varit instrumental för att upptäcka regulatoriska domäner (11). Denna metod kartlägger diskreta platser i genomet där konformationen av kromatin gör dess DNA överkänsligt för klyvning av endonukleaset DNas I (12).
Vad är en nukleasöverkänslig plats i kromatin?
Inkromatin, nukleosomfria regioner kända som nukleasöverkänsliga platser tros representera de "öppna fönstren" som tillåter ökad åtkomst av avgörande inhemska cis-verkande DNA-sekvenser till transverkande faktorer (se Refs..