Eftersom sonikering potentiellt kan bryta ned proteiner och denaturera proteinepitoper, utvärderade vi sedan effekten av sonikering på proteinintegriteten.
Kan ultraljudsbehandling skada proteiner?
Populära svar (1)
Standard ultraljudsprotokoll kan snarare inte orsaka proteinfragmentering- energin är för låg. Det borde inte ens orsaka dess denaturering. Det kan denatureras när du sonikerar det för länge och överhettar provet. Om du använder nickelkromatografi kan andra band helt enkelt vara föroreningar.
Kan sonikering bryta peptidbindningar?
Sonication kan norm alt inte bryta upp ett proteins primära struktur eftersom den strukturen (aminosyrasekvensen) är konstruerad av kovalenta bindningar som är många gånger starkare än vätebindningar och sonikering kan ge den energi som krävs för att bryta dessa bindningar.
Knyter ultraljudsbehandling kärnmembranet?
A kort ultraljudsbehandling med låg energi kan störa plasmamembranet utan att bryta för många mitokondriella eller nukleära membran och ge efter i taktiska mitokondrier.
Är sonikering nödvändigt för proteinextraktion?
Tvättmedelssolubilisering (t.ex. SDS) som krävs för isolering av membranproteiner resulterar i ett limliknande lysat främst på grund av nukleinsyror. Sonikering krävs därför i sådana fall för att störa dessa nukleinsyror. Sonikering genererar mycket värme och är inte bra förmånga proteiner.