Prolin finns ofta i slutet av α-helixen eller i svängar eller slingor. Till skillnad från andra aminosyror som nästan uteslutande finns i transformationen i polypeptider, kan prolin existera i cis-konfigurationen i peptider.
Innehåller alfaspiraler prolinrester?
Nu när det finns över 30 000 proteinstrukturer i proteindatabanken är det tydligt att prolinrester finns i α-helixar, där de ofta spelar viktiga roller i proteinets struktur och funktion.
Vilka aminosyror finns i alfaspiraler?
Val som helst av de 20 aminosyrorna kan delta i en α-helix men vissa är mer gynnade än andra. Ala, Glu, Leu och Met finns oftast i spiraler medan Gly, Tyr, Ser och Pro är mindre benägna att ses.
Innehåller betaark prolin?
Proline är inte favoriserad i betaarkstrukturer eftersom det inte kan fullborda H-bonding-nätverket. När prolin förekommer i ark kan det vara i en utbuktning eller arkkant där avsaknaden av en aminovätebindningsdoner inte är kritisk.
Vad innehåller alfaspiraler?
Alfahelixen (α-helix) är ett vanligt motiv i proteinernas sekundära struktur och är en högerhandshelixkonformation där varje ryggrad N−H-grupp väte binder till ryggraden C=O. grupp av aminosyran som ligger fyra rester tidigare längs proteinsekvensen.