BLAST kan användas för flera ändamål. Dessa inkluderar identifiering av arter, lokalisering av domäner, fastställande av fylogeni, DNA-kartläggning och jämförelse. Med användning av BLAST kan du möjligen korrekt identifiera en art eller hitta homologa arter.
Vad används BLAST till?
BLAST är en datoralgoritm som är tillgänglig för användning online på National Center for Biotechnology Information (NCBI) webbplats, såväl som många andra webbplatser. BLAST kan snabbt justera och jämföra en fråge-DNA-sekvens med en databas med sekvenser, vilket gör den till ett viktigt verktyg i pågående genomisk forskning.
Vad är BLAST-teknik?
BLAST-tekniken är en metod för att lösa klagomål som utvecklats av Albert Barneto . Mnemoniken står för Tro, Lyssna, Ursäkta, Tillfredsställa och Tacka (Tabell 1). 6. Den här artikeln beskriver dess användbarhet i patientvård och som ett kliniskt undervisningsverktyg.
Hur fungerar BLAST DNA?
Hur fungerar BLAST? BLAST identifierar homologa sekvenser med hjälp av en heuristisk metod som initi alt hittar korta matchningar mellan två sekvenser; sålunda tar metoden inte hänsyn till hela sekvensutrymmet. Efter den första matchen försöker BLAST starta lokala justeringar från dessa inledande matcher.
Varför är BLAST snabbare än Fasta?
När det gäller algoritmens körtidskomplexitet är BLAST snabbare än FASTA genom att endast söka efter de mer signifikanta mönstren isekvenser. Känsligheten (eller noggrannheten) hos BLAST och FASTA tenderar att vara olika för nukleinsyra- och proteinsekvenser (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
