Arabinos är ett socker med fem kolatomer som finns mycket i naturen och kan fungera som den enda kolkällan i många bakterier. Proteinprodukterna från tre gener (araB, araA och araD) behövs för arabinosnedbrytning i medlemmar av familjen Enterobacteriaceae, såsom E. coli och S.
Vad gör arabinos med bakterier?
När arabinos är närvarande för att slå på arabinosoperonet, produceras GFP och bakterierna kan fluorescera. Utan arabinos uttrycks inte GFP-genen och det finns ingen fluorescens. Så genom att variera näringssammansättningen kan en forskare kontrollera när (och om) florescens inträffar i de transformerade bakterierna.
Vilken roll har arabinos i bakteriell transformation?
Arabinose fungerar som en allosterisk regulator av AraC, och ändrar vilka DNA-ställen den binder till och hur den bildar en dimer. Kom ihåg att arabinos är sockret som kataboliseras av proteinerna i AraBAD-operonet. När arabinos tillsätts till miljön där E. coli lever, binder den tätt till AraC.
Varför används arabinos?
Användning i biologi
I syntetisk biologi används arabinos ofta som en enkelriktad eller reversibel switch för proteinuttryck under Pbadpromotor i E. coli. Denna på-omkopplare kan upphävas genom närvaron av glukos eller vändas av genom tillsats av glukos i odlingsmediet, vilket är en form av katabolitrepression.
Hurpåverkar arabinos genreglering och uttryck i bakterier?
När arabinos är närvarande, araC slappnar av DNA-konfigurationen så att transkription kan ske, men när denna kolhydrat är frånvarande, begränsar samma protein DNA:t att minska dess förmåga att binda med RNA-polymeras.
