Inom molekylärbiologi är STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) en biologisk databas och webbresurs med kända och förutspådda protein–protein-interaktioner. … Den senaste versionen 11b innehåller information om cirka 24,5 miljoner proteiner från mer än 5000 organismer.
Vad är syftet med STRING-databasen?
STRING-databasen syftar till att samla in och integrera denna information, genom att konsolidera kända och förutspådda proteinassociationsdata–proteinassociationsdata för ett stort antal organismer.
Vad är ett STRING-poäng?
I STRING är varje protein-protein-interaktion kommenterad med en eller flera "poäng". Viktigt är att dessa poäng inte indikerar styrkan eller specificiteten hos interaktionen. Istället är de indikatorer på förtroende, det vill säga hur sannolikt STRING bedömer att en interaktion är sann, givet tillgängliga bevis.
Varför interagerar proteiner?
Protein–proteininteraktioner (PPI) är fysiska kontakter med hög specificitet etablerade mellan två eller flera proteinmolekyler som ett resultat av biokemiska händelser som styrs av interaktioner som inkluderar elektrostatiska krafter, väte bindning och den hydrofoba effekten.
Vad är funktionell association?
definition. Binärt förhållande mellan biologiska entiteter när en av dem modulerar den andra i termer av funktion, uttryck, nedbrytning eller stabilitet hos den andra och relationenmellan partnerna kan inte fastställas som direkta, så mellanliggande steg är implicit närvarande.
