Däremot faller de flesta eukaryota DNA-ligaser, tillsammans med arkeala och bakteriofagenzymer, in i den andra underfamiljen; dessa enzymer använder ATP som en kofaktor.
Kräver ligaser ATP?
Två DNA-ligaser används vanligtvis. … T4-ligas kräver ATP medan E. coli-ligas kräver NAD+ (Nikotinamidadenindinukleotid är ett koenzym som består av 2 nt sammanfogade genom deras fosfatgrupper). Båda katalyserar sammanfogningen av en 5'-fosfat- och en 3'-OH-grupp för att bilda en fosfodiesterbindning.
Varför behöver ligaser ATP?
DNA-ligeringsreaktionens två steg
DNA-ligeringsreaktionen i sig har två grundläggande steg. För det första måste DNA-ändarna kollidera av en slump och hålla ihop tillräckligt länge för att ligasen ska kunna ansluta sig till dem. … För att tillåta enzymet att utföra ytterligare reaktioner måste AMP i enzymets aktiva ställe fyllas på med ATP.
Vilken funktion har ligaser?
DNA-ligaser spelar en viktig roll för att upprätthålla genomisk integritet genom att sammanfoga brott i fosfodiester-ryggraden i DNA som uppstår under replikering och rekombination, och som en konsekvens av DNA-skada och dess reparera. Tre mänskliga gener, LIG1, LIG3 och LIG4 kodar för ATP-beroende DNA-ligaser.
Vad är ligaser fungerar de aktivt eller passivt?
DNA-ligas är aktivt under replikeringen, reparations- och rekombinationsprocessen av DNA. Det används i stor utsträckning vid reparation av enkelsträngadbryter i duplex-DNA från levande organismer med hjälp av den komplementära strängen av dubbelhelixen som mall, medan vissa former specifikt kan reparera dubbelsträngsskador.
