Eftersom DdNTPs har en vätemolekyl (-H) istället för en hydroxylgrupp (-OH) bunden till 3'-C av dess deoxiribos, kan den inte binda till några inkommande nukleotider. Därför kan tillägg av DdNTP under DNA-replikering användas för att avsluta syntesreaktionen.
Varför stoppar DNA-syntesen när en ddNTP införlivas i den växande DNA-strängen?
Om den tillsatta nukleotiden är en "dideoxinukleotid" (Figur 6.29), kommer 3'-änden av den växande strängen nu att ha ett H, snarare än en OH. Detta kommer att förhindra att ytterligare nukleotider läggs till; d.v.s. in vitro DNA-syntes kommer att stoppas vid denna tidpunkt.
Hur avslutar en ddNTP DNA-syntes?
När en ddNTP inkorporeras i en kedja av nukleotider, avslutas syntesen. Detta beror på att ddNTP-molekylen saknar en 3'-hydroxylgrupp, som krävs för att bilda en länk med nästa nukleotid i kedjan.
Varför avslutar DdNTP:er replikeringsprocessen?
Laboratory Methods in Enzymology: DNA
dideoxinukleotid trifosfater inkorporeras lätt i en växande DNA-kedja, men saknar den 3′-hydroxylgrupp som krävs för att kedjan ska fortsätta, och effektivt avsluta polymerisationen.
Varför orsakar dideoxinukleotider att DNA-replikationen upphör?
Dessa ddNTP:er saknar en 3′-OH-grupp som krävs för bildandet av en fosfodiesterbindning mellan tvånukleotider, vilket gör att förlängningen av DNA-strängen stannar när en ddNTP läggs till.
